從*的角度來說，PCR 由變性--退火--延伸三個基本反應步驟構成：

1、模板 DNA 的變性：模板 DNA 經加熱至 94℃ 左右一定時間后，使模板 DNA 雙鏈或經 PCR 擴增形成的雙鏈 DNA 解離，使之成為單鏈，以便它與引物結合，為下輪反應做準備；

2、模板 DNA 與引物的退火 （復性）：模板 DNA 經加熱變性成單鏈后，溫度降至 55℃ 左右，引物與模板 DNA 單鏈的互補序列配對結合；

3、引物的延伸：DNA 模板--引物結合物在 Taq 酶的作用下，以 dNTP 為反應原料，靶序列為模板，按堿基配對與半保留復制原理，合成一條新的與模板 DNA 鏈互補的半保留復制鏈。

重復循環變性--退火--延伸三過程，就可獲得更多的「半保留復制鏈」，而且這種新鏈又可成為下次循環的模板。每完成一個循環需 2～4 分鐘， 2～3 小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。